Sind wir schon da - Wo ist die GeneTox IG?!

Das SENDIG-GeneTox-Projekt steht kurz vor der Fertigstellung, wobei der Schwerpunkt auf In-vivo-Mikronukleus- und Comet-Tests liegt. Die öffentliche Prüfung wird für Anfang Q3 2022 erwartet, die endgültige Freigabe für Q1 2023.

Diese Woche habe ich mich mit meinem Kollegen und SEND-besessenen Kollegen Mike Wasko unterhalten, der das CDISC-Team leitet, das den SEND-Standard für genetische Toxikologie entwickelt. Ich fragte ihn: "Was ist der aktuelle Umfang und Zeitplan des SEND Genetox Implementation Guide?", und hier ist, was er zu sagen hatte:

"Zunächst ist etwas Kontext angebracht. Das CDISC SEND GeneTox Team, das 2015 gegründet wurde, hat in einem sich entwickelnden Zustand gearbeitet, da es viele Änderungen in Bezug auf Umfang, Führung und sogar CDISC-Praktiken gegeben hat. Ursprünglich sollten Domänen modelliert und erstellt werden, um In-vivo-Micronucleus- und Comet-Assays sowie In-vitro-Micronucleus- und In-vitro-Ames-Assays zu unterstützen. Zusätzlich zur Darstellung der Rohdaten und des Versuchsdesigns für In-vivo-Daten plante das Team, eine Möglichkeit zur Darstellung historischer Kontrolldaten zu finden. In-vitro-Daten und historische Kontrolldaten sind zwei Konzepte, an die sich noch kein CDISC-Team herangewagt hatte. 

Bei der Arbeit des Teams an den Umfangsinitiativen wurde deutlich, dass In-vitro- und historische Kontrolldaten aus gutem Grund nicht in Betracht gezogen worden waren. Es war äußerst schwierig, Daten darzustellen, ohne dass ein Proband mit den Daten verbunden war. Nach vielen Versuchen und Irrungen wurde beschlossen, den Geltungsbereich auf den kleinsten effektiven Geltungsbereich zu reduzieren, der Forschern und Behörden eine Möglichkeit bieten würde, die Genetox-Daten zumindest für in vivo zu standardisieren. Damit könnte eine Grundlage für die Zukunft geschaffen werden, und es könnten Erfahrungen gesammelt werden. Dies wäre vergleichbar mit dem Prozess der Freigabe von SENDIG v3.0: Die Industrie implementiert, und die gewonnenen Erkenntnisse bilden die Grundlage für künftige Versionen. So wurde der Umfang auf In-vivo-Micronucleus- und In-vivo-Comet-Tests reduziert. Nach Rücksprache mit den Behörden wurde dann entschieden, dass historische Daten nicht einbezogen werden müssen. Der Grundgedanke war, dass entweder die Methoden zu komplex wären, um historische Daten darzustellen, oder dass dies die Größe/Breite der GeneTox SEND-Domäne, die die Rohdaten darstellt, stark erhöhen würde. Weder das eine noch das andere war ideal; daher wurde vereinbart, historische Daten zu entfernen. 

Nach der Entscheidung über den verbesserten Anwendungsbereich ist die Arbeit in der SEND GeneTox IG schnell vorangekommen. Dabei wurden neue CDISC-Praktiken eingeführt. Derzeit ist der IG-Entwurf fast vollständig, einschließlich 3 detaillierter Beispiele, die das Folgende darstellen:

  • in vivo Mikronukleustest auf der Grundlage von Objektträgern,
  • In-vivo-Mikronukleustest auf der Grundlage des Flusses und
  • in vivo Comet-Tests. 

Das Team hat bereits mit dem Controlled Terminology Team zusammengearbeitet, um eine kontrollierte Terminologie zu entwickeln und arbeitet mit dem SEND Conformance Rules Team zusammen. Als Teil der neueren CDISC-Prozesse muss eine IG nicht nur Beispiele enthalten, sondern für die interne und öffentliche Überprüfung durch CDISC auch die Konformitätsregeln sowie Proof of Concept-Datensätze. Dies wird eine gründlichere Überprüfung ermöglichen und Agenturen und Anbietern die Möglichkeit geben, mit ihren SEND-Tools zu bewerten. Der aktuelle Fahrplan sieht vor, dass das SENDIG-GeneTox Anfang des dritten Quartals 2022 zur öffentlichen Prüfung vorgelegt wird, wobei die Genehmigung und Veröffentlichung hoffentlich bis Ende des ersten Quartals 2023 erfolgt. Es war ein Weg voller Herausforderungen und Veränderungen, aber das Team hat sich zusammengerauft und wird es schaffen."

Ich finde, das ist ein großartiges Update, das Mike mitteilt.

Wie immer können Sie sich gerne an der Diskussion beteiligen und mir eine Nachricht an instem schicken.

Bis zum nächsten Mal,

Marc

Marc Ellison

Marc Ellison ist der Direktor von SEND Solutions bei Instem und seit 12 Jahren ehrenamtlicher CDISC-Mitarbeiter. Er verfügt über drei Jahrzehnte Erfahrung in der Entwicklung von nicht-klinischer Software und in der Zusammenarbeit mit Forschern bei der optimalen Erfassung und Organisation ihrer Daten. Marc bezeichnet sich selbst als "SEND-Nerd" und interessiert sich leidenschaftlich für die Konzepte, Debatten und Entwicklungen rund um den SEND-Standard. Als starker Verfechter der Bedeutung von SEND für die Beschleunigung der Forschung hat Marc bei Instem einen eigenen Blog mit dem Titel "Sensible SEND" ins Leben gerufen, um Forscher mit aktuellen Details und Erklärungen zu dem sich ständig weiterentwickelnden Prozess zu informieren und vorzubereiten.

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