Optimierung von Vorhersagemodellen unter Verwendung von Wissen, das aus eigenen Daten abgeleitet wurde  

In Silico-Insider: Candice Johnson, PhD

Computergestützte Methoden sind für die Bewertung der potenziellen Risiken von Verbindungen, für die keine experimentellen Daten vorliegen, unerlässlich, wobei die Sensibilisierung der Haut ein kritischer Endpunkt bei der Bewertung der chemischen Sicherheit ist. Die Integration von Wissen aus eigenen Datenquellen in In-silico-Modelle hat bereits gezeigt, dass die Vorhersagegenauigkeit und Zuverlässigkeit von In-silico-Modellen erhöht werden kann. 

Optimierung von Vorhersagemodellen unter Verwendung von Wissen, das aus eigenen Daten abgeleitet wurde

Vor kurzem hat Leadscope mit der Industrie zusammengearbeitet, um unsere Hautsensibilisierungsmodelle zu aktualisieren. Die Bemühungen umfassten die Integration von Wissen aus eigenen Datenquellen in die Wissensbasis des regelbasierten Expertensystems. Außerdem wurden mehrere hundert neue Strukturen in die Trainings- und Referenzdatenbank aufgenommen. In Zusammenarbeit mit Industriepartnern wurden historische Hautsensibilisierungsdaten für 925 Verbindungen gesammelt, die im Local Lymph Node Assay (LLNA) oder im Guinea Pig Maximization Test (GPMT) untersucht wurden. Die aktualisierten Modelle zeigten eine Genauigkeit von 82 % bei der Vorhersage von starken/extremen Sensibilisierungsergebnissen in einem geschützten Datensatz. Diese Studie stützt die Hypothese, dass Wissen aus UnternehmensdatenbankenIn-silico-Modelle mit erweiterten Vorhersagefähigkeiten und -leistungen advance kann.  

Wir freuen uns, die Ergebnisse dieser Zusammenarbeit im Rahmen eines Symposiums mit dem Titel 'Extraction of Knowledge from Proprietary Datasets for the Advancement of QSAR Models' (Extraktion von Wissen aus proprietären Datensätzen zur Weiterentwicklung von QSAR-Modellen) auf der 64. Jahrestagung der SOT und der ToxExpo in Orlando, Florida, vorzustellen (Mittwoch,19. März, 9.05-9.35 Uhr, Raum W203A).

Bitte kontaktieren Sie uns, um mit einem Experten zu sprechen, oder erfahren Sie hier mehr über unsere Lösungen.

Candice Johnson, PhD

Candice Johnson, PhD, ist Senior Research Scientist bei Instem. Dr. Johnson ist Mitverfasserin mehrerer von Experten begutachteter Veröffentlichungen, in denen die Umsetzung von In-silico-Ansätzen und Methoden zur Gewinnung von Vertrauen in In-silico-Vorhersagen beschrieben werden. Ihre Arbeit erstreckt sich auf neuartige Anwendungen von In-silico-Ansätzen und unterstützt die Weiterentwicklung alternativer Methoden. Ihr besonderes Interesse gilt der Anwendung von computergestützten Werkzeugen zur Unterstützung toxikologischer Bewertungen, zum Beispiel bei der Bewertung von extrahierbaren und auslaugbaren Stoffen.

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